婴儿发烧39℃是否严重需根据具体病因进行判断 ， 如为普通的细菌或病毒感染通常不严重 。如果为脑炎所导致的发烧属于较为严重的情况 。
1.不严重
大多数婴儿出现发烧39℃的情况是由于细菌或病毒进入体内，在机体大量繁殖所导致的症状，由于高烧症状在细菌或病毒被消杀后会促使体温逐步回归正常，对机体的器官并不会造成较为严重的损伤，如果没有出现惊厥、抽搐的症状 ， 属于不严重的情况 。2.严重
【婴儿发烧39度严重吗】如果婴儿发烧是由于脑炎或脑膜炎等颅内感染所导致，当体温达到39℃的时候属于较为严重情况，应及时配合医生进行降温治疗 ， 并对脑炎和脑膜炎进行彻底根治，防止体温异常升高，对脑部细胞造成损伤，影响婴儿的成长和智力发育 。
所以婴儿出现发烧39℃的情况 ， 并前往医院查明病因 ， 无论严重与否，都应该积极配合医生进行治疗 。